洁净室工程主要是是洁净室的建设，洁净室又可以分为工业洁净室，生物洁净室，其中工业洁净室主要是以控制空气中的尘埃，在洁净室内部呈正压。工业洁净室一般在机械工业，化学工业，电子工业，光磁工业，电脑硬盘，液晶玻璃等多个行业用到的比较多。生物洁净室主要是将细菌和尘埃清除掉，将工作区域保持洁净状态。其中生物洁净室又可以分为两类，一般生物洁净室和生物学安全洁净室，一般生物洁净室主要是控制细菌。而生物学安全洁净室，主要是控制有害物体，保证人体和外界不受污染。

洁净室是将区域范围内的有害气体，细菌，污染雾清除干净，将其排除，把此工作区域范围的压力，气流，噪音，温度，洁净度，静电等控制在合理的需求范围内，并且无论其他外界环境中空气的质量发生何种变化，对室内的空气不受到影响，室内的洁净度，温度等都会保持在原来的指标范围内。